أولغا خيرسونسكي ويزمان الفوركس

دان S توفيق المنشورات الكيمياء الحيوية. حلقة التطعيم وأصل الأنزيم الأنواع دان S توفيق قسم الكيمياء البيولوجية، معهد وايزمان للعلوم، ريهوفوت 76100، إسرائيل العلوم 311: 475-6. 2006 علم الأحياء الفوضوي وأصول الابتكارات التطورية دان ص توفيق قسم الكيمياء البيولوجية، معهد فايزمان للعلوم، رحوفوت، إسرائيل نات تشيم بيول 6: 692-6. 2010 حدوث المتلازمة وتجاوز تحويل الإطار الإدراج الحذف (إندلز) لإعطاء البروتينات الوظيفية ليات روكاه شموئيل قسم الكيمياء البيولوجية، معهد فايتسمان للعلوم، ريهوفوت، إسرائيل بلوس جينيت 9: e1003882. 2013 أرسينات استبدال الفوسفات: كيمياء الحياة البديلة و أيون برايسكويتي دان S توفيق قسم الكيمياء البيولوجية، معهد وايزمان للعلوم، روفويت 76100، إسرائيل الكيمياء الحيوية 50: 1128-34. 2011 تطور موجات من PON3 باراكسوناس المصل عن طريق خلط الأسرة و أنسيستوركونسنسوس الطفرات، وتوصيفها الكيمياء الحيوية أولغا خرسونسكي قسم الكيمياء البيولوجية، معهد وايزمان للعلوم، ريهوفوت 76100، إسرائيل الكيمياء الحيوية 48: 6644-54. 2009 التنوع التحفيزي والنسخ الاحتياطي في مواقع الإنزيم النشطة: حالة المصل باراكسوناز 1 موشيه بن ديفيد قسم علم الأحياء الهيكلي، معهد وايزمان للعلوم، ريهوفوت 76100، إسرائيل J مول بيول 418: 181-96. 2012 أبو يحفز المصل باراكسوناس النشاط PON1 والاستقرار مماثلة ل أبوا-I ليونيد غايدوكوف قسم الكيمياء البيولوجية، معهد فايتسمان للعلوم، ريهوفوت 76100، إسرائيل الكيمياء الحيوية 49: 532-8. 2010 الهستيدين 115-هيستيدين 134 دياد يتوسط نشاط اللاكتوناز من ثدييات مصل الثدييات أولغا خيرسونسكي قسم الكيمياء البيولوجية، معهد وايزمان للعلوم، أولمان بناء، ريهوفوت 76100، إسرائيل J بيول تشيم 281: 7649-56. 2006 إعادة ترتيب أيونات المعادن التحفيزية تسلط الضوء على الاختلاط والتطور من ميتالونزيمي موشيه بن داود قسم علم الأحياء الهيكلي، معهد فايزمان للعلوم، ريوفوت 76100، إسرائيل J مول بيول 425: 1028-38. 2013 هدرولاسيس ستيروسيلكتيف تطورت ل طيف واسعة من نوع G إزالة الأعصاب وكيل من نوع G موش غولدسميث قسم الكيمياء البيولوجية، معهد فايتسمان للعلوم، ريهوفوت 76100، إسرائيل تشيم بيول 19: 456-66. 2012 معلومات تفصيلية المنشورات 89 الكيمياء الحيوية. حلقة التطعيم وأصل الأنزيم الأنواع دان S توفيق قسم الكيمياء البيولوجية، معهد وايزمان للعلوم، ريهوفوت 76100، إسرائيل العلوم 311: 475-6. 2006 علم الأحياء الفوضوي وأصول الابتكارات التطورية دان ص توفيق قسم الكيمياء البيولوجية، معهد فايزمان للعلوم، رحوفوت، إسرائيل نات تشيم بيول 6: 692-6. 2010 لأفضل أو للأسوأ، الفوضى هي متأصلة في علم الأحياء. كما أنها توفر المواد الخام للتكيف الفسيولوجية والتطورية للتحديات الجديدة. الارتباط المترابط وتجاوز تحويل الإطار الإدراج الحذف (إندلز) لإعطاء البروتينات الوظيفية ليات روكاه شموئيل قسم الكيمياء البيولوجية، معهد فايتسمان للعلوم، ريهوفوت، إسرائيل بلوس جينيت 9: e1003882. 2013 على الرغم من الحصول عليها في المختبر، تشير نتائجنا إلى وجود صلة مباشرة بين حدوث وراثي إندلز والإنقاذ المظهري، مما يشير إلى دور محتمل ل إندلز تحول الإطار كما سد وسيطة التطورية. أرسينات استبدال الفوسفات: كيمياء الحياة البديلة والأيونية الاختلاط دان S توفيق قسم الكيمياء البيولوجية، معهد وايزمان للعلوم، روفويت 76100، إسرائيل الكيمياء الحيوية 50: 1128-34. 2011 وأخيرا، فإننا نسلط الضوء على التطبيقات المحتملة من الزرنيخات كمسبار هيكلي والميكانيكي من الانزيمات التي ردود الفعل المحفزة تنطوي على صنع أو كسر السندات فوسفهويستر. تطور موجات من PON3 باراكسوناس المصل عن طريق خلط الأسرة و أنسيستوركونسنسوس الطفرات، وتوصيفها الكيمياء الحيوية أولغا خرسونسكي قسم الكيمياء البيولوجية، معهد فايتسمان للعلوم، ريهوفوت 76100، إسرائيل الكيمياء الحيوية 48: 6644-54. 2009 PON3 أيضا وظائف يحتمل أن تكون مضادة للالتصلب الشرايين، على الرغم من أن في مستويات أقل من تلك PON1. التحفيز التحفيزي والنسخ الاحتياطي في المواقع النشطة الانزيم: حالة المصل باراكسوناس 1 موشيه بن داود قسم علم الأحياء الهيكلي، معهد فايتسمان للعلوم، ريهوفوت 76100، إسرائيل J مول بيول 418: 181-96. 2012 ملزمة الكالسيوم الحفاز وتفعيل الماء التحلل). وعموما، فإن التعايش بين العديد من التوافقات والأساليب التحفيزية البديلة في نفس الموقع النشط يؤكد على PON1s الاختلاط والإمكانات التطورية. أبو يحفز المصل باراكسوناز PON1 النشاط والاستقرار مماثلة ل أبوا-I ليونيد غايدوكوف قسم الكيمياء البيولوجية، معهد فايتسمان للعلوم، ريهوفوت 76100، إسرائيل الكيمياء الحيوية 49: 532-8. 2010 الهستيدين 115-هيستيدين 134 دياد يتوسط نشاط اللاكتوناز من ثدييات مصل الثدييات أولغا خيرسونسكي قسم الكيمياء البيولوجية، معهد وايزمان للعلوم، أولمان بناء، ريهوفوت 76100، إسرائيل J بيول تشيم 281: 7649-56. 2006 على حد علمنا، وهذا هو واحد من أمثلة قليلة من ديست الحامض الاميني في مواقع نشطة الانزيم والمثال الأول للانزيم التحلل مع هذا دياد. إعادة ترتيب أيون المعادن التحفيزية تسلط الضوء على الاختلاط والتطور من ميتالونزيم موشيه بن داود قسم علم الأحياء الهيكلي، معهد وايزمان للعلوم، ريهوفوت 76100، إسرائيل J مول بيول 425: 1028-38. 2013 وهكذا، فإن مرونة أيونات المعادن موقع نشط قد تسمح البديلة، الكامنة، الأنشطة الفاسدة وأيضا توفير الأساس لتباعد وظائف الأنزيمية الجديدة. تطورت هدرولاسيس ستيريوسلكتيف للطيف واسعة النطاق من نوع G إزالة الأعصاب وكيل الأعصاب موشيه غولدسميث قسم الكيمياء البيولوجية، معهد وايزمان للعلوم، ريوفوت 76100، إسرائيل تشيم بيول 19: 456-66. 2012 نظرا إلى قدرتها على تحلل العوامل G، يمكن أن تكون هذه المتغيرات المتطورة بمثابة واسع النطاق G - وكيل الوقاية. الاستفادة المثلى من السيليكو تصميم كيمب إليميناس KE70 حسب التصميم الحسابي والتطور الموجه أولغا خيرسونسكي قسم الكيمياء البيولوجية، معهد وايزمان للعلوم، ريهوفوت 76100، إسرائيل J مول بيول 407: 391-412. 2011 البروتينات المتحولة توسط التحولات التطورية للهيكل إيتامار يديد قسم الكيمياء الحيوية، وإسرائيل مركز بروتيوميكس الهيكلي، معهد وايزمان للعلوم، ريهوفوت 76100، إسرائيل بروك ناتل أكاد سسي U S A 107: 7287-92. 2010 تشير بياناتنا أيضا إلى أن القدرة على تسلسل واحد للتوازن بين الهياكل المختلفة يمكن أن يكون الأمثل التطوري، مما يسهل ظهور هياكل جديدة. سد الفجوات في منهجيات التصميم من خلال التحسين التطوري للاستقرار والكفاءة من كيمب إليميناس KE59 أولغا خيرسونسكي قسم الكيمياء البيولوجية، معهد وايزمان للعلوم، ريهوفوت 76100، إسرائيل بروك ناتل أكاد سسي U S A 109: 10358-63. 2012 وعموما، فإن التطور الموجه من ثلاثة مختلفة مصممة كيمب إليميناسس، KE07، KE70، و KE59، يدل على أن التصاميم الحسابية هي قابلة للتطوير للغاية ويمكن أن يكون الأمثل لكفاءة الحفازة العالية. الانجرافات المحايدة المكثفة تنتج بروتينات توافق قوية وقابلة للتطور شيمون بيرشتين قسم الكيمياء البيولوجية، معهد فايتسمان للعلوم، ريوفوت، 76100، إسرائيل J مول بيول 379: 1029-44. 2008 وتشير النتائج أيضا إلى أنه يمكن التنبؤ بالتغيرات التي يمكن الرجوع إليها إلى توافق الآراء في المختبر لتوليد مكتبات جينية متنوعة للغاية ومتطورة. فحص عالية الإنتاجية لمكتبات الانزيم: ثيولاكتوناسس تطورت من قبل الفرز تنشيط مضان من خلايا واحدة في مقصورات مستحلب أمير أهاروني قسم الكيمياء البيولوجية، معهد فايزمان للعلوم، ريهوفوت 76100، إسرائيل تشيم بيول 12: 1281-9. 2005 و 192RQ بوليمورفس من المصل باراوكسوناز PON1 تختلف في هدل ملزمة، التحفيز ليبولاكتوناز، وانبعاث الكولسترول ليونيد غايدوكوف قسم الكيمياء البيولوجية، معهد وايزمان للعلوم، ريهوفوت، إسرائيل J ليبيد ريس 47: 2492-502. 2006 في المختبر إزالة السموم من سيكلوسارين في الدم البشري قبل حضن السابقين الحي مع باراكسوناسيس المصل المؤتلف ياكوف أشاني قسم علم الأحياء الهيكلي، معهد وايزمان للعلوم، ريهوفوت 76100، إسرائيل توكسيكول ليت 206: 24-8. 2011 سمحت النتائج أيضا بتنقيح نموذج رياضي لتقدير الجرعة الفعالة من المتغيرات rePON1s المطلوبة للوقاية في البشر. التحسين التطوري للإنزيمات المصممة حسابيا: إزالة كيمب من سلسلة KE07 أولغا خيرسونسكي قسم الكيمياء البيولوجية، معهد وايزمان للعلوم، ريهوفوت 76100، إسرائيل J مول بيول 396: 1025-42. 2010 دراسات هيكلية تفاعلية من المصل باروكسوناز PON1 تشير إلى أن نشاطها الأصلي هو لاكتوناز أولغا خيرسونسكي قسم الكيمياء البيولوجية، معهد وايزمان للعلوم، ريهوفوت 76100، إسرائيل الكيمياء الحيوية 44: 6371-82. 2005 هذه، والمعدلات العالية نسبيا تقاس مع العديد من ركائز لاكتون (k (كات) K (M) ما يقرب من 10 (6) M (-) (1) ق (-) (1)) يعني أن PON1 هو في الواقع لاكتوناز . كيف استقرار البروتين وظائف جديدة التجارة نوبوهيكو توكوريكي قسم الكيمياء البيولوجية، معهد فايتسمان للعلوم، ريهوفوت، إسرائيل بلوس كومبوت بيول 4: e1000002. 2008 وهكذا، فإن تطور الأنشطة الأنزيمية الجديدة، سواء في الطبيعة أو في المختبر، يعتمد على التأثير التعويضي، والاستقرار في الطفرات الصامتة على ما يبدو في مناطق البروتين التي لا علاقة لها وظيفتها. مقايسات الكروموجينيك والفلوروجينيك لنشاط اللاكتوناز من باراكسوناسيس المصل أولغا خيرسونسكي قسم الكيمياء البيولوجية، معهد وايزمان للعلوم، ريهوفوت 76100، إسرائيل شيمبيوشيم 7: 49-53. 2006 أصول تطورية إنزيمات إزالة السموم: باراكسوناسيس المصل الثدييات (بونز) تتعلق لاكتوناسيس هوميروسين البكتيرية هاجيت بار روجوفسكي من قسم الكيمياء البيولوجية، معهد فايتسمان للعلوم، ريهوفوت 76100، إسرائيل J بيول تشيم 288: 23914-27. 2013 في الجسم الحي إدارة بل-3050: مستقرة للغاية هندستها PON1-هدل المجمعات ليونيد غايدوكوف قسم الكيمياء البيولوجية، معهد وايزمان للعلوم، ريهوفوت، إسرائيل بمك كلين فارماكول 9:18. 2009 يتناول هذا العمل جدوى في إدارة الجسم الحي من RePON1، ومجمع هدل، كعامل علاجي يحتمل أن يطلق عليها اسم بل-3050. بعد المسارات التطورية لتفاعلات البروتين البروتين مع تقارب عالية والانتقائية كاليا بيرناث ليفين قسم الكيمياء البيولوجية، معهد فايتسمان للعلوم، ريهوفوت، إسرائيل نات ستروكت مول بيول 16: 1049-55. 2009 توجيه تطور البروتينات للتعبير والاستقرار غير متجانسة سينتيا رودفلدت قسم الكيمياء البيولوجية، معهد فايتسمان للعلوم، ريهوفوت 76100، إسرائيل كور رأي البني بيول 15: 50-6. 2005 الأنشطة المشتركة الفاسدة والسمات التطورية في مختلف أفراد عائلة أميدوهيدرولاز سينتيا رودفلدت قسم الكيمياء البيولوجية، معهد وايزمان للعلوم، 76100 ريوفوت، إسرائيل الكيمياء الحيوية 44: 12728-36. 2005 وظيفية - إكتينس بروبيلر من قبل التكرار جنبا إلى جنب وحدات متكررة إيتامار يديد قسم الكيمياء البيولوجية، معهد وايزمان للعلوم، ريهوفوت 76100، إسرائيل بروتين إنغ ديس سيل 24: 185-95. 2011 أظهرت هذه النتائج القدرة على بناء بروتينات تكرار كروية مطوية وظيفية، ودعم دور الازدواجية والانصهار من الوحدات الابتدائية في الطرق التطورية التي أدت إلى أضعاف - propellers. الأساس الجزيئي للتمييز الفوسفات في البيئات الغنية بالزرنيخ ميكايل الياس قسم الكيمياء البيولوجية، معهد فايزمان للعلوم، ريهوفوت 76100، إسرائيل الطبيعة 491: 134-7. 2012 هذه الميزات تمكن نظام نقل الفوسفات لربط الفوسفات بشكل انتقائي على الزرنيخ (على الأقل 10 (3) فائض) حتى في البيئات الغنية بالزرنيخ. تطور تطور السلفوترانسفيراس و الباروكسونات من قبل مكتبات الأجداد أوريا ألكولومبري قسم الكيمياء البيولوجية، معهد فايزمان للعلوم، ريوفوت 76100، إسرائيل J مول بيول 411: 837-53. 2011 تقارب عالية، والاستقرار، ونشاط اللاكتوناز من المصل باراكسوناز PON1 الراسية على هدل مع أبوا-I ليونيد غايدوكوف قسم الكيمياء البيولوجية، معهد فايتسمان للعلوم، ريهوفوت 76100، إسرائيل الكيمياء الحيوية 44: 11843-54. 2005 عموما، تشير النتائج إلى ارتفاع الاستقرار، والانتقائية، والكفاءة الحفازة من PON1 عندما ترسو على أبوا-I هدل، نحو ركائز لاكتون، والاكتونات محبة للدهون على وجه الخصوص. تطور هدرولاسس للوقاية من G - نوع التسمم وكيل الأعصاب رينكو D غوبتا قسم الكيمياء البيولوجية، معهد فايتسمان للعلوم، ريهوفوت، إسرائيل نات تشيم بيول 7: 120-5. 2011 ثم أظهرنا في الجسم الحي النشاط الوقائي لمتغير تطورت. هذه المتغيرات المتقدمة والشاشات وضعت حديثا توفر الأساس للهندسة PON1 للوقاية ضد وكلاء G - نوع الأخرى. عالمية التبعية الأنزيمية معدل الحرارة التبعية ميكايل الياس قسم الكيمياء البيولوجية، معهد فايتسمان للعلوم، ريهوفوت 76100، إسرائيل العنوان الالكتروني اتجاهات بيوشيم سسي 39: 1-7. 2014 من بين العوامل الأخرى، يمكن أن يعزى هذا فقدان معدل التسارع إلى الاهتزازات التي يسببها حراريا التي تهدد التكوين الحفاز موقع نشط، مما يشير إلى أن العديد من الإنزيمات هي في الواقع غير جامدة بما فيه الكفاية. ما الذي يجعل بروتين أضعاف قابلة للابتكار وظيفي أضعاف قطبية والاستقرار المفاضلات إينات ديلوس-غور قسم الكيمياء البيولوجية، معهد وايزمان للعلوم، ريهوفوت 76100، إسرائيل J مول بيول 425: 2609-21. 2013 يقترح عملنا تدابير هيكلية قطبية أضعاف يبدو أنها ترتبط مع الابتكار، وبالتالي توفير رؤى جديدة بشأن تطور البروتين والتصميم والهندسة. هندسة الإنزيم من قبل المكتبات المستهدفة موشيه غولدسميث قسم الكيمياء البيولوجية، معهد فايتسمان للعلوم، رحوفوت، إسرائيل أساليب إنزيمول 523: 257-83. 2013 وأخيرا، يتم تقييم كفاءة التصميم والأحمال الطفرية المثلى من المكتبات بمقارنة المكتبات الطفرية المستهدفة مقابل مكتبات الطفرات العشوائية. ديناميكية البروتين والتطور نوبوهيكو توكوريكي قسم الكيمياء البيولوجية، معهد وايزمان للعلوم، ريهوفوت 76100، إسرائيل العلوم 324: 203-7. 2009 هذا الرأي الديناميكي للبنية البروتينية، والوظيفة، و إفولفابيليتي هو استقراء لوصف سيناريوهات افتراضية لتطور البروتينات في وقت مبكر والاتجاهات البحثية المستقبلية في مجال ديناميكية البروتين والتطور. إنزيم برومسكويتي: منظور آلي وتطوري أولغا خيرسونسكي قسم الكيمياء البيولوجية، معهد فايتسمان للعلوم، ريهوفوت 76100، إسرائيل أنو ريف بيوشيم 79: 471-505. 2010 وأخيرا، نتعامل مع الفرضية القائلة بأن الأنشطة الأنزيمية المشوشة بمثابة نقاط انطلاق تطورية وتسلط الضوء على السمات التطورية الفريدة لوظائف الإنزيم المختلطة. تحول مهندسو البروتينات التطورية سيرجيو G بيساجوفيتش قسم الكيمياء البيولوجية، معهد وايزمان للعلوم، ريوفوت، 76100، إسرائيل طرق نات 4: 991-4. 2007 إنزيم برومسكويتي: الجوانب التطورية والميكانيكية أولغا خيرسونسكي قسم الكيمياء البيولوجية، معهد وايزمان للعلوم، ريهوفوت، إسرائيل كور الرأي كيم بيول 10: 498-508. 2006 إعادة بناء وصلة مفقودة في تطور فوسفهوتريستريز متباينة مؤخرا عن طريق إعادة عرض حلقة الموقع الفعال ليفنات أفريات-جرنو قسم الكيمياء البيولوجية، معهد وايزمان للعلوم، ريهوفوت 76100، إسرائيل الكيمياء الحيوية 51: 6047-55. 2012 إخراج انزيم توجيه: وراء الفاكهة شنقا منخفضة موشيه غولدسميث قسم الكيمياء البيولوجية، معهد وايزمان للعلوم، ريهوفوت، إسرائيل كور الرأي بيول 22: 406-12. 2012 يمكن دمج هذه المكتبات مع شاشات منخفضة الإنتاجية التي توفر دقة عالية وتستهدف مباشرة الركيزة المطلوبة وظروف التفاعل، وبالتالي توفير متغيرات محسنة للغاية. تطور موجات من مثبطات البروتين من نوكليسيس الحمض النووي عن طريق التقسيم في المختبر (إيفك) والتسليم قطرة نانو كاليا بيرناث قسم الكيمياء البيولوجية، معهد فايتسمان للعلوم، ريهوفوت 76100، إسرائيل J مول بيول 345: 1015-26. 2005 عملية التطور في المختبر تؤكد الفرضيات السابقة فيما يتعلق بآلية الربط كدوال ريكوغنيتيونكوت والطريقة التي أزواج مناعة الكوليستين الجديدة تختلف عن تلك الموجودة. آثار الاستقرار من الطفرات والبروتين قابلية التطور نوبوهيكو توكوريكي قسم الكيمياء البيولوجية، معهد وايزمان للعلوم، ريهوفوت 76100، إسرائيل كور الرأي بيول 19: 596-604. 2009 نحن تصف طرق التنبؤ وتحليل آثار الاستقرار من الطفرات، والآليات التي عازلة أو تعويض عن هذه الآثار المزعزعة للاستقرار، وبالتالي تعزيز تطور البروتين، في الطبيعة وفي المختبر. تشابيرونين أوفيركسريسيون يعزز الاختلاف الجيني وتطور الإنزيم نوبوهيكو توكوريكي قسم الكيمياء البيولوجية، معهد فايتسمان للعلوم، ريهوفوت 76100، إسرائيل طبيعة 459: 668-73. 2009 تشير هذه النتائج إلى أن استقرار البروتين هو عقبة رئيسية في تطور البروتين، وآليات التخزين المؤقت مثل تشابيرونينز هي المفتاح في تخفيف هذا القيد. شاشات عالية الإنتاجية والاختيارات من الجينات ترميز انزيم أمير أهاروني قسم الكيمياء البيولوجية، معهد وايزمان للعلوم، ريهوفوت 76100، إسرائيل كور الرأي كيم بيول 9: 210-6. 2005 ونحن نركز على النهج هتس التي تمكن من الاختيار من المكتبات الكبيرة (10 (6) المتغيرات الجينية) مع وسائل متواضعة نسبيا (أي النظم غير الروبوتية)، وعلى مقصورة في المختبر على وجه الخصوص. ويرتبط الاختلاط الكامنة من لاكتوناسيس الميكروبية التي تم تحديدها حديثا إلى فوسفهوتريستريز متباينة مؤخرا ليفنات أفريات قسم الكيمياء البيولوجية، معهد وايزمان للعلوم، ريهوفوت 76100، الكيمياء الحيوية إسرائيل 45: 13677-86. 2006 كان يمكن أن تتطور بت من عضو في أسرة بل مع الاستفادة من نشاطها الباروكسونزي الخارق الكامن كنقطة انطلاق أساسية. الدور المحتمل للطفرات المظهرية في تطور البروتين التعبير والاستقرار موشيه غولدسميث قسم الكيمياء البيولوجية، معهد وايزمان للعلوم، ريهوفوت 76100، إسرائيل بروك ناتل أكاد سسي U S A 106: 6197-202. 2009 ولذلك قد تلعب دورا في تشكيل الصفات البروتينية مثل مستويات التعبير، والاستقرار، والتسامح للطفرات الوراثية. دمج أوليغونوكلأوتيدس الاصطناعية عن طريق الجين إعادة التجميع (إيسور): أداة متعددة لتوليد المكتبات المستهدفة أسئل هيرمان قسم الكيمياء البيولوجية، معهد وايزمان للعلوم، ريهوفوت 76100، إسرائيل بروتين إنغ ديس سيل 20: 219-26. 2007 فحص هذه المكتبات أسفرت عن مجموعة من المسوخ مع خصائص الركيزة المتغيرة وأشار إلى أن بعض المناطق من هذا الإنزيم لديها التسامح عالية بشكل مدهش إندل. قابلية تطور وظائف البروتين المشوش أمير آهاروني قسم الكيمياء البيولوجية، معهد وايزمان للعلوم، ريهوفوت 76100، إسرائيل نات جينيت 37: 73-6. 2005 وهكذا، يمكن للبروتين المتطور الحصول في البداية على زيادة اللياقة البدنية لوظيفة جديدة دون أن تفقد وظيفتها الأصلية. وقد تترافق بعد ذلك ازدواجية الجينات واختلاف بروتين جديد تماما. التقدم في تطور المختبر من الانزيمات شيمون بيرشتين قسم الكيمياء البيولوجية، معهد وايزمان للعلوم، ريهوفوت 76100، إسرائيل كور الرأي كيم بيول 12: 151-8. 2008 نموذج أوهنوس إعادة النظر: قياس وتيرة الطفرات المحتملة التكيف تحت مختلف الانجرافات الطفرية شيمون بيرشتين قسم الكيمياء البيولوجية، معهد فايتسمان للعلوم، ريهوفوت، إسرائيل مول بيول إيفول 25: 2311-8. 2008 إجمالا، يبدو أن سيناريوهات التفرغ الوظيفي أكثر جدوى، حيث أن الحفاظ على الوظيفة الأصلية من نسختين يسهل تراكم الطفرات التي يمكن أن تتكيف مع تطهير الطفرات غير الوظيفية. بروتين الإدراج والحذف تمكينها التجوال محايدة في الفضاء تسلسل أغنس توث بيتروسزي قسم الكيمياء البيولوجية، معهد فايتسمان للعلوم، ريهوفوت، إسرائيل مول بيول إيفول 30: 761-71. 2013 ديناميات تراكم إندلز تعتمد أيضا على الترددات الجينومية-إندلز في الذباب هي 4 أضعاف أكثر تواترا مما كانت عليه في الخميرة وتميل إلى أن يتم تعويض بدلا من تمكين. علاقة ضجيج يعني في المروجين متحور جيل هورنونغ قسم الوراثة الجزيئية، معهد وايزمان للعلوم، ريهوفوت 76100، إسرائيل الجينوم ريس 22: 2409-17. 2012 تشير نتائجنا إلى أن حجم الانفجار هو خاصية المروج محددة نسبيا قوية لتسلسل الطفرات ولكن يعتمد بشدة على التفاعل بين مربع تاتا والمروج النيوكليوسومات. تطوير اختبارات المصل البشري ل PON1 المصل ملزمة هدل والنشاط ليبولاكتوناز لها ليونيد غايدوكوف قسم الكيمياء البيولوجية، معهد فايتسمان للعلوم، ريهوفوت 76100، إسرائيل J ليبيد ريس 48: 1637-46. 2007 80). هذه الاختبارات الجديدة تشير إلى مستويات ونشاط PON1 في سياق ذات الصلة فسيولوجيا وكذلك مستويات وجودة الجسيمات هدل التي يرتبط الانزيم. الآثار الطفيلية وتطور وظائف البروتين الجديدة ميشا سوسكين قسم الكيمياء البيولوجية، معهد وايزمان للعلوم، ريهوفوت 76100، إسرائيل نات ريف جينيت 11: 572-82. 2010 نقترح العديد من العوامل التي يمكن أن تؤثر على تباين وظائف البروتين الجديدة، بما في ذلك المفاضلة الطفرة والتباين الخفية، أو محايدة على ما يبدو. ترينز: طريقة لتعديل الجينات التي كتبها جنبا إلى جنب جنبا إلى جنب تكرار المتكررة ياكوف كيبنيس قسم الكيمياء البيولوجية، معهد فايتسمان للعلوم، ريهوفوت 76100، إسرائيل بروتين إنغ ديس سيل 25: 437-44. 2012 علينا أن نظهر هذا الأسلوب من خلال بناء ثلاث مكتبات الجينات المختلفة، وعن طريق اختيار المتغيرات الإدراج من تيم-1-اللاكتاماس. التحولات التطورية إلى ميثيل ترانزفيراسيس الحمض النووي الجديد من خلال توسيع الموقع المستهدف والانكماش ليات روكاه شموئيل قسم الكيمياء البيولوجية، معهد فايتسمان للعلوم، هيرتزل سانت، ريهوفوت 76100، إسرائيل الأحماض النووية ريس 40: 11627-37. 2012 نتائجنا تثبت السهولة التي تتطور بها دنا ملزمة جديدة وتعديل خصوصيات وآلية التي تحدث بها على حد سواء البروتين ومستويات الحمض النووي. ويبدو أن آثار استقرار الطفرات البروتينية توزع عالميا قسم نوبوهيكو توكوريكي الكيمياء البيولوجية، معهد وايزمان للعلوم، ريهوفوت 76100، إسرائيل J مول بيول 369: 1318-32. 2007 يتكون من أداة جديدة لتحليل البروتينات ونماذج البروتين، لمحاكاة تأثير الطفرات في ظل العمليات التطورية، ووصف كمي للصلابة الطافرة. الارتباط صلابة-إبيستاسيس يشكل المشهد اللياقة البدنية للبروتين الانجراف عشوائيا شيمون بيرشتين قسم الكيمياء البيولوجية، معهد فايتسمان للعلوم، ريهوفوت 76100، إسرائيل الطبيعة 444: 929-32. 2006 متانة العتبة هي بطبيعتها إبيستاتيك-بمجرد استنفاد عتبة الاستقرار، والآثار الضارة للطفرات تصبح واضحة تماما، مما يجعل البروتينات أقل قوة بكثير مما يفترض عموما. إعادة بناء الميكروبات بيتا المروحة وظيفية عن طريق التجميع هومو أوليجوميريك من شظايا أقصر إيتامار ياديد قسم الكيمياء البيولوجية، معهد فايتسمان للعلوم، ريهوفوت 76100، إسرائيل J مول بيول 365: 10-7. 2007 الهندسة V - نوع وكلاء العصبية إزالة السموم الانزيمات باستخدام المكتبات التي تركز حسابيا إزاك تشيرني قسم الكيمياء البيولوجية، معهد وايزمان للعلوم، ريهوفوت 76100، إسرائيل أكس تشيم بيول 8: 2394-403. 2013 هذه المحفزات الجديدة توفر الأساس لطيف واسع إزالة السموم وكيل الأعصاب. آليات التباعد تسلسل البروتين وعدم التوافق ألون ويلنر قسم الكيمياء البيولوجية، معهد فايتسمان للعلوم، ريهوفوت، إسرائيل بلوس جينيت 9: e1003665. 2013 ومع ذلك، كما اقترح من قبل المختبر تمكين K219S الصرف، نظرا ما يكفي من الوقت والتباين في مستويات الاختيار، حتى الحفاظ تماما والمخلفات الأساسية وظيفيا قد تتغير. انخفاض العائدات والمقاومات تقيد تحسين المختبر من إنزيم نوبوهيكو توكوريكي مايكل سميث مختبرات، جامعة كولومبيا البريطانية، فانكوفر، كولومبيا البريطانية، كندا V6T 1Z4 نات كومون 3: 1257. 2012 وتشير هذه النتائج أيضا إلى أن الكفاءة التحفيزية وخصوصية العديد من الانزيمات الطبيعية قد تكون بعيدة عن الأمثل. الاختلاف والتقارب في تطور الانزيم: تطور مواز للباروكسوناس من لاكتوناس تكملة النصاب من ميكايل الياس قسم الكيمياء البيولوجية، معهد وايزمان للعلوم، ريهوفوت 76100، إسرائيل J بيول تشيم 287: 11-20. 2012 تطور انزيم توجيه عن طريق المكتبات الانجراف محايدة صغيرة وفعالة رينكو D غوبتا قسم الكيمياء البيولوجية، معهد وايزمان للعلوم، ريهوفوت 76100، إسرائيل نات طرق 5: 939-42. 2008 تطور طبولوجيا البروتين الجديدة من خلال إعادة ترتيب الجينات متعددة المراحل سيرجيو G بيساجوفيتش قسم الكيمياء البيولوجية، معهد فايتسمان للعلوم، ريوفوت، 76100 إسرائيل نات جينيت 38: 168-74. 2006 تبين نتائجنا أن طبولوجيا البروتين الجديدة يمكن أن تتطور تدريجيا من خلال إعادة ترتيب الجينات متعددة المراحل وتوفير رؤى جديدة بشأن هذه العمليات. التطور الموجه لنشاط الاسترياز المختلط للأنهيدراز الكربوني إي ستيفن ماك جولد قسم الكيمياء البيولوجية، معهد وايزمان للعلوم، ريهوفوت 76100، إسرائيل الكيمياء الحيوية 44: 5444-52. 2005 نتائجنا تدعم فكرة أن تطور وظيفة جديدة يمكن أن تكون مدفوعة من الطفرات التي تزيد من وظيفة مختلطة (الذي هو بمثابة نقطة الانطلاق للعملية التطورية) ولكن لا تضر بالوظيفة الأم. دور الكيمياء مقابل الركيزة ملزمة في تجنيد وظائف انزيم مختلطة أولغا خيرسونسكي قسم الكيمياء البيولوجية، معهد فايتسمان للعلوم، ريوفوت 76100، إسرائيل الكيمياء الحيوية 50: 2683-90. 2011 يمكن أن تجد رسو تشيموفور أيضا تطبيقات عملية في تحديد المحفزات لردود الفعل غير الطبيعية. هل البروتينات الفيروسية تمتلك ميزات بيوفيزيائية فريدة من نوعها نوبوهيكو توكوريكي قسم الكيمياء البيولوجية، معهد فايتسمان للعلوم، ريهوفوت 76100، اتجاهات إسرائيل بيوشيم سسي 34: 53-9. 2009 التطور الموجه لباراوكسونات الثدييات PON1 و PON3 للتعبير البكتيري والتخصص الحفاز أمير أهاروني قسم الكيمياء البيولوجية، معهد وايزمان للعلوم، ريهوفوت 76100، إسرائيل بروك ناتل أكاد سسي U S A 101: 482-7. 2004 يقدم تحليل المتغيرات الحديثة تطورا في العلاقات التطورية بين مختلف أفراد الأسرة. تجنب والتحكم التحف التحول المزدوج موشيه غولدسميث قسم الكيمياء البيولوجية، معهد وايزمان للعلوم، ريهوفوت، إسرائيل بروتين إنغ ديس سيل 20: 315-8. 2007 هذا البروتوكول يحتاج إلى تطبيق لأي متغير جديد معزولة من ذخيرة الجينات غير المتجانسة، وعلى وجه الخصوص للمتغيرات معزولة عن طريق اختيار إما النشاط الأنزيمي، أو ملزمة. الانزيم المعتدل الكفاءة: الاتجاهات التطورية والكيميائية الفيزيائية تشكيل المعلمات الانزيم أرن بار حتى قسم علوم النبات، معهد وايزمان للعلوم، ريهوفوت، إسرائيل الكيمياء الحيوية 50: 4402-10. 2011 كما يبدو من المرجح أن الكفاءة الحفزية لبعض الانزيمات نحو ركائزها الطبيعية يمكن أن تزداد في كثير من الحالات عن طريق التطور الطبيعي أو المختبري. في المختبر المجزأة من قبل مستحلبات مزدوجة: الفرز وإثراء الجينات عن طريق مضان تنشيط خلية الفرز كاليا بيرناث قسم الكيمياء البيولوجية، معهد وايزمان للعلوم، ريهوفوت 76100، إسرائيل بيوشيم الشرج 325: 151-7. 2004 قدرة الأجهزة فاكس لفرز ما يصل إلى 40000 الأحداث في الثانية الواحدة قد توفر هذه التكنولوجيا إمكانات واسعة في مجال فحص عالية الإنتاجية والتطور الموجه من الانزيمات. الأجسام المضادة استيروليتيك كما النماذج الميكانيكية والهيكلية من هدرولاسس - التحليل الكمي ارييل B ليندنر قسم علم المناعة، معهد فايتسمان للعلوم، ريهوفوت 76100، إسرائيل J مول بيول 320: 559-72. 2002 نوقشت نتائجنا بالمقارنة مع استراتس سيرين، وعلى وجه الخصوص، مع إستيراس الكوكايين (كوك)، التي تمتلك ثقب أوكسيانيون على أساس التيروزين. تملي معدلات التطور البطيء للبروتين من قبل جمعية سطح الأساسية أغنس توث بيتروسزي قسم الكيمياء البيولوجية، معهد وايزمان للعلوم، ريهوفوت 76100، إسرائيل بروك ناتل أكاد سسي U S A 108: 11151-6. 2011 إذا كان السطح غير قابل للوصول إلى بدائل، لذلك يصبح جوهر، مما أدى إلى معدلات عامة بطيئة جدا. الإمكانيات التطورية الكامنة تحت الانجراف المحايد من انزيم جيل اميتاي قسم الكيمياء البيولوجية، معهد وايزمان للعلوم، ريهوفوت 76100، إسرائيل هفسب J 1: 67-78. 2007 المحفزات القضاء كيمب من تصميم انزيم الحسابية دانييلا رثليسبرجر قسم الكيمياء الحيوية، جامعة واشنطن، سياتل، واشنطن 98195، الولايات المتحدة الأمريكية الطبيعة 453: 190-5. 2008 تظهر هذه النتائج قوة الجمع بين تصميم البروتين الحاسوبي مع تطور الموجه لخلق الإنزيمات الجديدة، ونحن نتوقع إنشاء مجموعة واسعة من المحفزات الجديدة المفيدة في المستقبل. هيكل وحركية وسيطة ملزمة ملزمة الأجسام المضادة تكشف عن آلية التمييز الحركي في التعرف على مستضد ليو جيم جيمس مختبر البيولوجيا الجزيئية، مجلس البحوث الطبية، كامبريدج CB2 2HQ، المملكة المتحدة بروك ناتل أكاد سسي U S A 102: 12730-5. 2005 قد ينطبق هذا النموذج على البروتينات التي تربط بروابط متعددة بطريقة معينة أو البروتينات الأخرى التي، على الرغم من أن قادرة على ربط العديد من بروابط، يتم تفعيلها من قبل عدد قليل فقط. المحاليل المشوشة لمواقع الحمض النووي غير المتعارف عليها من قبل هاييي ميثيلترانزفيراس هيلين M كوهين مركز مرك للهندسة البروتين ومختبر مرك للبيولوجيا الجزيئية ومركز مركز موارد المهاجرين، هيلز الطريق، كامبريدج CB2 2QH، المملكة المتحدة وقسم الكيمياء البيولوجية، معهد وايزمان للعلوم، ريهوفوت 76 100، إسرائيل نوكليك أسيدس ريس 30: 3880-5. 2002 قد يكون مثيلة الجسم الحي من المواقع غير المتعارف عليها هامة وقد تكون قد وفرت نقطة الانطلاق لتطور أنظمة تعديل التقييد مع خصائص تسلسل جديدة. التحقيق في التعرف على الهدف من الحمض النووي سايتوزين -5 ميثيل ترانسفيراس هاي عن طريق اختيار المكتبة باستخدام في المختبر المقصورة يين فاي لي مختبر مرك من البيولوجيا الجزيئية ومركز للهندسة البروتين ومركز مركز موارد المهاجرين، هيلز الطريق، كامبريدج CB2 2QH، المملكة المتحدة الأحماض النووية ريس 30: 4937 -44. 2002 تشير نتائجنا إلى أن الاعتراف بأزواج القاعدة 3 و 4 من الموقع المستهدف يعتمد اعتمادا كليا على تفاعلات السلسلة الرئيسية أو أن المخلفات المختلفة عن تلك المحددة في التركيب البلوري تساهم في التعرف على الحمض النووي. تطور موجبة من فوسفهوتريستريز سريع للغاية من خلال التخسيس في المختبر أندرو د غريفيثس مختبر مرك البيولوجيا الجزيئية، كامبريدج CB2 2QH، المملكة المتحدة إمبو J 22: 24-35. 2003 هذه العملية في المختبر تماما يختار لجميع الميزات الأنزيمية في وقت واحد (الاعتراف الركيزة، وتشكيل المنتج، تسارع معدل ودوران) وجزيئات انزيم واحد يمكن الكشف عنها. Conformational diversity and protein evolution--a 60-year-old hypothesis revisited Leo C James Centre for Protein Engineering, Hills Road, Cambridge, UK CB2 2HQ Trends Biochem Sci 28:361-8. 2003 Miniaturising the laboratory in emulsion droplets Andrew D Griffiths Institut de Science et d Ingnierie Supramolculaires ISIS, 8 allee Gaspard Monge, BP 70028, F 67083 Strasbourg cedex, France Trends Biotechnol 24:395-402. 2006 This review describes the scope and potential of IVC in areas such as in vitro evolution of proteins and RNAs, cell-free cloning and sequencing, genetics, genomics, and proteomics. Directed evolution by in vitro compartmentalization Oliver J Miller MRC Laboratory of Molecular Biology, Hills Road, Cambridge, CB2 2QH, UK Nat Methods 3:561-70. 2006 Enhanced stereoselective hydrolysis of toxic organophosphates by directly evolved variants of mammalian serum paraoxonase Gabriel Amitai Division of Medicinal Chemistry, Israel Institute for Biological Research, Ness Ziona, Israel FEBS J 273:1906-19. 2006 Altering the sequence specificity of HaeIII methyltransferase by directed evolution using in vitro compartmentalization Helen M Cohen MRC Centre for Protein Engineering and MRC Laboratory for Molecular Biology, Cambridge CB2 2QH, UK Protein Eng Des Sel 17:3-11. 2004 This study provides a rare example of a laboratory-evolved enzyme whose catalytic efficiency surpasses that of the wild-type enzyme with the principal substrate. The catalytic histidine dyad of high density lipoprotein-associated serum paraoxonase-1 (PON1) is essential for PON1-mediated inhibition of low density lipoprotein oxidation and stimulation of macrophage cholesterol efflux Mira Rosenblat Lipid Research Laboratory, Technion Faculty of Medicine, Haifa 31096, Israel J Biol Chem 281:7657-65. 2006 Structure and evolution of the serum paraoxonase family of detoxifying and anti-atherosclerotic enzymes Michal Harel Department of Structural Biology, The Weizmann Institute of Science, Rehovot 76 100, Israel Nat Struct Mol Biol 11:412-9. 2004 Determinants of cofactor binding to DNA methyltransferases: insights from a systematic series of structural variants of S-adenosylhomocysteine Helen M Cohen MRC Laboratory of Molecular Biology, MRC Centre, Hills Road, Cambridge, UK CB2 2QH Org Biomol Chem 3:152-61. 2005 An understanding of the binding of AdoHyc to methyltransferases will greatly assist the design of AdoMet inhibitors. Protein promiscuity: drug resistance and native functions--HIV-1 case Ariel Fernandez Center for Computational Biology and Bioinformatics, Indiana University School of Medicine, Indianapolis, IN 46202, USA J Biomol Struct Dyn 22:615-24. 2005Olga Khersonsky 2006-2007 Institution of PhD: Weizmann Institute of Science Academic Discipline of PhD: Chemistry PhD Advisors: Prof. Dan Tawfik Dissertation Topic: Mechanistic Enzymology: From Classical Tools to Directed Evolution Year Awarded PhD: 2009 Institution of Postdoc: University of Washington Present Institution: Weizmann Institute of Science Present Academic Position: Senior Intern Email: olga. khersonskyweizmann. ac. il CV Publications Homepage Olga Khersonsky is a biological chemist primarily interested in enzymology, directed evolution, computational design and synthetic biology. She is currently a senior intern at the Weizmann Institute of Science, Rehovot, working in Dr. Sarel Fleishmans lab. Olga was awarded her PhD in 2009 by the Weizmann Institute of Science. Her thesis, 8220Mechanistic Enzymology From Classical Tools to Directed Evolution8221 was written under the supervision of Prof. Dan Tawfik. In recognition of her outstanding work during this time, she was awarded the Chorafas Prize for Excellent PhD Research as well as the Teva Prize for Outstanding PhD Students. After completing her PhD, Olga received the EMBO Long-Term Fellowship for her postdoctoral studies, She then spent three years in the University of Washington working in Prof. David Bakers lab. Her research focused on computational denovo design of hydrolytic enzymes, their characterization and directed evolution. Born in Kiev, Olga moved to Israel at the age of 11 and was later recruited to the IDFs Atuda (Academic Reserve) program. She completed two BScs in both chemistry and environmental science in the Hebrew University of Jerusalem before serving as an academic officer. Olga started her MSc studies in the Weizmann Institute during her four-year military service. Upon discharge, she continued her studies and started work on her thesis, Mechanistic Enzymology and Physiological Substrates of Serum Paraoxonase 1. Her thesis was written under the supervision of Prof. Dan Tawfik. Olgas work has been published widely in top journals such as Journal of Molecular Biology, Biochemistry, ChemBioChem, and the Journal of Biological Chemistry . Much of Olgas research in enzymology and directed evolution is designed to generate enzymes with tailor-made properties she believes such research may lead to the development of enzymes that will eventually be used for medicinal purposes.